Shinichi Kudo นักสืบต้นแบบอายุสิบเจ็ดปีมีทุกอย่าง เขาสามารถแก้ไขกรณีใด ๆ ที่นำความสนใจของเขาและในการบันทึกเวลา เพื่อนชาวมัธยมปลายของเขาวิ่งเป็นผู้เชี่ยวชาญคาราเต้และพ่อของเธอเป็นผู้หญิงที่เป็นนวล ผู้ที่ขับเคลื่อนอย่างบ้าคลั่งด้วยความจริงที่ว่า Shinichi ได้รับกรณีที่ยอดเยี่ยมทั้งหมด วันหนึ่งในขณะที่ Shinichi และ Ran อยู่ที่สวนสนุกทั้งคู่จะแยกออกจากกัน Shinichi จับลมของข้อตกลงที่สกปรกลงไปและสายลับบนผู้ชายคู่หนึ่งในร่องรอยมืด เขาถูกจับและผู้ชายใช้พิษทดลองกับเขาตั้งใจที่จะฆ่าเขา อย่างไรก็ตามสิ่งต่าง ๆ ไม่ทำงานอย่างแน่นอนตามแผนที่วางไว้ เมื่อ Shinichi มาถึงความรู้สึกของเขาเขาพบว่าเขาหดตัวลงกับขนาดของนักเรียนชั้นประถมศึกษาปีที่สี่ เขาไปที่นักประดิษฐ์ Goofball ที่อาศัยอยู่ถัดไปให้เขาเพื่อขอความช่วยเหลือและนักประดิษฐ์ตกลงที่จะมอบมือให้เขา เมื่อวิ่งหา Shinichi เขาและนักประดิษฐ์ก็คิดว่า Shinichi เป็นเด็กชื่อ Conan Edogawa (โคนันเช่นเดียวกับ Sir Arthur Conan Doyle) วิ่งเพื่อให้ "โคนัน" อยู่กับครอบครัวของเธอในขณะที่ "ครอบครัว" ของเขาอยู่ห่างออกไป Shinichi จากนั้นทำภารกิจของเขาถึงหนึ่งวันพบผู้ชายที่วางยาพิษเขาและรับยาแก้พิษ ดังนั้นสรุป backstory ต่อซีรีส์ ในแต่ละตอนโคนันแก้ปัญหาที่แตกต่างกันในรูปแบบของนักสืบที่ดีทั้งหมดแสดงคำแนะนำเพื่อช่วยให้ผู้ชมพยายามเดาว่าวายร้ายเป็นใครในขณะที่พยายามรักษาความเป็นตัวตนที่แท้จริงของเขาเป็นความลับ